Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sdr42e1Q9D665 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sdr42e1Q9D665 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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