Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW6

Rnf146, E3 ubiquitin-protein ligase RNF146, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf146Q9CZW6 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rnf146Q9CZW6 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf146Q9CZW6 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rnf146Q9CZW6 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rnf146Q9CZW6 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rnf146Q9CZW6 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rnf146Q9CZW6 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf146Q9CZW6 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Rnf146Q9CZW6 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Rnf146Q9CZW6 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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