Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih4Q9CX13 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cnih4Q9CX13 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cnih4Q9CX13 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cnih4Q9CX13 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cnih4Q9CX13 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cnih4Q9CX13 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cnih4Q9CX13 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cnih4Q9CX13 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cnih4Q9CX13 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cnih4Q9CX13 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnih4Q9CX13 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnih4Q9CX13 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnih4Q9CX13 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnih4Q9CX13 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnih4Q9CX13 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnih4Q9CX13 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnih4Q9CX13 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnih4Q9CX13 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnih4Q9CX13 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnih4Q9CX13 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnih4Q9CX13 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnih4Q9CX13 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms