Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms