Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ndufb9Q9CQJ8 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ndufb9Q9CQJ8 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ndufb9Q9CQJ8 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ndufb9Q9CQJ8 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ndufb9Q9CQJ8 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ndufb9Q9CQJ8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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