Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tdrd1Q99MV1 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms