Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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