Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Uhrf1Q8VDF2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms