Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC66

Ssx2ip, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx2ipQ8VC66 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssx2ipQ8VC66 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms