Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc12Q8K2L8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.4 ms