Protein–RNA interactions for Protein: Q8K212

Pacs1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, mousemouse

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Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs1Q8K212 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pacs1Q8K212 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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