Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LgsnQ8CIX8 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms