Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc63Q8CDV6 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms