Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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Usp20Q8C6M1 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Usp20Q8C6M1 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Usp20Q8C6M1 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Usp20Q8C6M1 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Usp20Q8C6M1 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Usp20Q8C6M1 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Usp20Q8C6M1 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Usp20Q8C6M1 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Usp20Q8C6M1 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp20Q8C6M1 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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