Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atg16l1Q8C0J2 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
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