Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Lmod1Q8BVA4 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmod1Q8BVA4 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms