Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tspan12Q8BKT6 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.3 ms