Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrfn4Q80XU8 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Lrfn4Q80XU8 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lrfn4Q80XU8 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lrfn4Q80XU8 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lrfn4Q80XU8 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lrfn4Q80XU8 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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Lrfn4Q80XU8 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrfn4Q80XU8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrfn4Q80XU8 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrfn4Q80XU8 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Lrfn4Q80XU8 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrfn4Q80XU8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrfn4Q80XU8 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrfn4Q80XU8 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrfn4Q80XU8 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrfn4Q80XU8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Lrfn4Q80XU8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Lrfn4Q80XU8 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrfn4Q80XU8 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrfn4Q80XU8 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Lrfn4Q80XU8 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrfn4Q80XU8 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrfn4Q80XU8 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrfn4Q80XU8 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrfn4Q80XU8 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrfn4Q80XU8 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrfn4Q80XU8 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrfn4Q80XU8 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrfn4Q80XU8 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrfn4Q80XU8 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrfn4Q80XU8 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrfn4Q80XU8 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrfn4Q80XU8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrfn4Q80XU8 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrfn4Q80XU8 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrfn4Q80XU8 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrfn4Q80XU8 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrfn4Q80XU8 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms