Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttc28Q80XJ3 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Ttc28Q80XJ3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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