Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kcnf1Q7TSH7 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnf1Q7TSH7 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms