Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms