Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc6aQ78XR0 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trappc6aQ78XR0 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trappc6aQ78XR0 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trappc6aQ78XR0 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trappc6aQ78XR0 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trappc6aQ78XR0 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trappc6aQ78XR0 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Trappc6aQ78XR0 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trappc6aQ78XR0 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trappc6aQ78XR0 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trappc6aQ78XR0 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6aQ78XR0 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6aQ78XR0 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6aQ78XR0 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6aQ78XR0 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
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Trappc6aQ78XR0 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6aQ78XR0 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6aQ78XR0 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6aQ78XR0 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6aQ78XR0 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6aQ78XR0 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6aQ78XR0 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Trappc6aQ78XR0 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6aQ78XR0 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6aQ78XR0 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6aQ78XR0 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6aQ78XR0 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6aQ78XR0 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6aQ78XR0 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6aQ78XR0 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6aQ78XR0 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6aQ78XR0 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6aQ78XR0 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6aQ78XR0 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6aQ78XR0 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6aQ78XR0 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6aQ78XR0 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6aQ78XR0 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6aQ78XR0 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6aQ78XR0 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6aQ78XR0 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6aQ78XR0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6aQ78XR0 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6aQ78XR0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6aQ78XR0 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6aQ78XR0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6aQ78XR0 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc6aQ78XR0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc6aQ78XR0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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