Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
BC061212Q6P8K3 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms