Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms