Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgd6Q69ZL1 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgd6Q69ZL1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgd6Q69ZL1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgd6Q69ZL1 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgd6Q69ZL1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgd6Q69ZL1 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgd6Q69ZL1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgd6Q69ZL1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgd6Q69ZL1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgd6Q69ZL1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgd6Q69ZL1 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgd6Q69ZL1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgd6Q69ZL1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgd6Q69ZL1 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgd6Q69ZL1 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgd6Q69ZL1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgd6Q69ZL1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgd6Q69ZL1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgd6Q69ZL1 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgd6Q69ZL1 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgd6Q69ZL1 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgd6Q69ZL1 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgd6Q69ZL1 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgd6Q69ZL1 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgd6Q69ZL1 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgd6Q69ZL1 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgd6Q69ZL1 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgd6Q69ZL1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgd6Q69ZL1 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgd6Q69ZL1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgd6Q69ZL1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgd6Q69ZL1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgd6Q69ZL1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgd6Q69ZL1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgd6Q69ZL1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgd6Q69ZL1 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgd6Q69ZL1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgd6Q69ZL1 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgd6Q69ZL1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Fgd6Q69ZL1 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgd6Q69ZL1 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms