Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctnna3Q65CL1 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnna3Q65CL1 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms