Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf4Q64287 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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