Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Zfp248Q640N4 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Zfp248Q640N4 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Zfp248Q640N4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Zfp248Q640N4 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Zfp248Q640N4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Zfp248Q640N4 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Zfp248Q640N4 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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Zfp248Q640N4 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Zfp248Q640N4 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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