Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Polr2kQ63871 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms