Protein–RNA interactions for Protein: Q4FK66

Prpf38a, Pre-mRNA-splicing factor 38A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38aQ4FK66 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf38aQ4FK66 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf38aQ4FK66 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf38aQ4FK66 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf38aQ4FK66 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf38aQ4FK66 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf38aQ4FK66 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf38aQ4FK66 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf38aQ4FK66 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf38aQ4FK66 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf38aQ4FK66 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prpf38aQ4FK66 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prpf38aQ4FK66 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prpf38aQ4FK66 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prpf38aQ4FK66 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prpf38aQ4FK66 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prpf38aQ4FK66 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Prpf38aQ4FK66 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms