Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ccdc185Q3V118 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ccdc185Q3V118 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ccdc185Q3V118 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc185Q3V118 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ccdc185Q3V118 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ccdc185Q3V118 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ccdc185Q3V118 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc185Q3V118 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc185Q3V118 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc185Q3V118 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc185Q3V118 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc185Q3V118 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc185Q3V118 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc185Q3V118 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc185Q3V118 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc185Q3V118 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc185Q3V118 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc185Q3V118 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc185Q3V118 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc185Q3V118 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc185Q3V118 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc185Q3V118 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc185Q3V118 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc185Q3V118 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc185Q3V118 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc185Q3V118 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc185Q3V118 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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