Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kdm5aQ3UXZ9 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms