Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms