Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc34Q3UI66 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccdc34Q3UI66 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms