Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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