Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rnf149Q3U2C5 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms