Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms