Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MitfQ08874 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MitfQ08874 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
MitfQ08874 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MitfQ08874 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
MitfQ08874 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MitfQ08874 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MitfQ08874 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
MitfQ08874 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
MitfQ08874 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms