Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NrepQ07475 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NrepQ07475 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NrepQ07475 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NrepQ07475 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms