Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms