Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EgfrQ01279 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms