Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gjb2Q00977 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms