Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmsP97355 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmsP97355 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SmsP97355 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SmsP97355 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SmsP97355 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SmsP97355 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SmsP97355 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SmsP97355 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SmsP97355 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SmsP97355 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SmsP97355 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SmsP97355 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SmsP97355 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SmsP97355 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SmsP97355 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SmsP97355 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SmsP97355 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SmsP97355 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SmsP97355 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SmsP97355 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SmsP97355 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SmsP97355 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SmsP97355 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SmsP97355 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SmsP97355 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SmsP97355 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SmsP97355 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SmsP97355 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SmsP97355 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SmsP97355 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SmsP97355 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SmsP97355 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SmsP97355 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SmsP97355 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SmsP97355 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SmsP97355 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SmsP97355 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SmsP97355 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SmsP97355 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SmsP97355 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SmsP97355 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SmsP97355 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SmsP97355 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SmsP97355 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SmsP97355 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SmsP97355 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SmsP97355 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SmsP97355 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SmsP97355 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SmsP97355 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
SmsP97355 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SmsP97355 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SmsP97355 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SmsP97355 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SmsP97355 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SmsP97355 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.35
SmsP97355 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SmsP97355 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SmsP97355 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SmsP97355 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SmsP97355 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SmsP97355 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SmsP97355 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SmsP97355 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SmsP97355 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SmsP97355 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SmsP97355 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SmsP97355 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SmsP97355 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SmsP97355 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SmsP97355 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SmsP97355 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SmsP97355 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SmsP97355 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SmsP97355 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SmsP97355 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SmsP97355 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SmsP97355 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SmsP97355 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SmsP97355 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SmsP97355 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SmsP97355 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SmsP97355 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SmsP97355 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SmsP97355 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SmsP97355 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SmsP97355 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SmsP97355 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SmsP97355 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SmsP97355 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SmsP97355 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SmsP97355 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SmsP97355 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SmsP97355 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SmsP97355 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SmsP97355 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SmsP97355 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SmsP97355 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SmsP97355 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms