Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Usp9xP70398 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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