Protein–RNA interactions for Protein: P61079

Ube2d3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d3P61079 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d3P61079 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
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