Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Cldn18P56857 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Cldn18P56857 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Cldn18P56857 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Cldn18P56857 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Cldn18P56857 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Cldn18P56857 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Cldn18P56857 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Cldn18P56857 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Cldn18P56857 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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