Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Rad23bP54728 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Rad23bP54728 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
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Rad23bP54728 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Rad23bP54728 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Rad23bP54728 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Rad23bP54728 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Rad23bP54728 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Rad23bP54728 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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Rad23bP54728 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Rad23bP54728 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Rad23bP54728 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad23bP54728 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
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