Protein–RNA interactions for Protein: P50652

Fancc, Fanconi anemia group C protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanccP50652 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FanccP50652 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FanccP50652 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FanccP50652 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FanccP50652 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FanccP50652 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FanccP50652 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FanccP50652 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FanccP50652 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FanccP50652 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FanccP50652 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FanccP50652 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FanccP50652 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FanccP50652 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FanccP50652 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FanccP50652 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FanccP50652 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FanccP50652 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FanccP50652 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FanccP50652 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FanccP50652 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FanccP50652 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FanccP50652 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FanccP50652 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FanccP50652 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FanccP50652 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FanccP50652 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FanccP50652 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FanccP50652 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FanccP50652 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FanccP50652 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FanccP50652 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FanccP50652 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FanccP50652 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FanccP50652 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FanccP50652 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FanccP50652 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FanccP50652 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FanccP50652 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FanccP50652 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FanccP50652 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FanccP50652 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FanccP50652 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FanccP50652 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FanccP50652 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FanccP50652 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FanccP50652 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FanccP50652 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FanccP50652 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FanccP50652 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FanccP50652 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FanccP50652 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FanccP50652 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FanccP50652 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FanccP50652 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FanccP50652 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FanccP50652 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FanccP50652 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FanccP50652 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FanccP50652 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FanccP50652 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FanccP50652 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FanccP50652 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FanccP50652 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FanccP50652 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FanccP50652 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FanccP50652 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FanccP50652 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FanccP50652 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FanccP50652 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FanccP50652 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FanccP50652 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FanccP50652 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FanccP50652 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FanccP50652 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FanccP50652 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FanccP50652 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FanccP50652 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FanccP50652 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FanccP50652 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FanccP50652 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FanccP50652 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FanccP50652 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FanccP50652 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FanccP50652 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FanccP50652 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FanccP50652 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FanccP50652 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FanccP50652 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FanccP50652 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FanccP50652 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FanccP50652 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FanccP50652 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FanccP50652 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FanccP50652 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FanccP50652 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FanccP50652 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FanccP50652 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FanccP50652 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FanccP50652 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms