Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpreP49446 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpreP49446 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpreP49446 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpreP49446 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpreP49446 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PtpreP49446 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtpreP49446 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtpreP49446 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PtpreP49446 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtpreP49446 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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PtpreP49446 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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PtpreP49446 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpreP49446 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpreP49446 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpreP49446 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtpreP49446 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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