Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nedd4P46935 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms